MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 10457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018533	A	8	8	11	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018533	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018533	GGGGA	2	10	3677	3686	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018533	AGG	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018533	TAT	2	6	3750	3755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018533	ACTA	2	8	3786	3793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018533	A	11	11	3821	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018533	A	8	8	3874	3881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018533	A	6	6	7772	7777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018533	ATT	2	6	7819	7824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018533	ACA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018533	CTT	2	6	8743	8748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018533	ATTT	2	8	8758	8765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018533	TTA	2	6	8784	8789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018533	TG	3	6	8861	8866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018533	T	6	6	8933	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018533	AAT	2	6	8948	8953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018533	CAA	2	6	8966	8971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018533	AGA	2	6	8983	8988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018533	GAG	2	6	9007	9012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018533	TGGTT	2	10	9025	9034	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018533	T	7	7	9099	9105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018533	GAA	2	6	9116	9121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018533	CTT	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018533	T	7	7	9152	9158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018533	AAT	2	6	9190	9195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018533	AAG	2	6	9260	9265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018533	TGAC	2	8	9279	9286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018533	TTC	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018533	TC	3	6	9303	9308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018533	TTAC	2	8	9459	9466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018533	AAG	2	6	9475	9480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018533	AAAAT	2	10	9508	9517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018533	A	7	7	9531	9537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018533	TAA	2	6	9583	9588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018533	GTT	2	6	9665	9670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018533	AGG	2	6	9699	9704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018533	A	6	6	9720	9725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018533	TTA	2	6	9745	9750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018533	CG	3	6	9796	9801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018533	TAA	2	6	9804	9809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018533	CTG	2	6	12086	12091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018533	GT	3	6	12094	12099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018533	TAA	2	6	12182	12187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018533	A	6	6	12224	12229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018533	ATG	2	6	12247	12252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018533	A	6	6	12270	12275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018533	CAT	2	6	12290	12295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018533	T	7	7	12897	12903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018533	ATGC	2	8	12919	12926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018533	AT	3	6	12934	12939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018533	TAAAA	2	10	12953	12962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018533	A	6	6	12968	12973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018533	GA	3	6	13045	13050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018533	GTATGT	2	12	13773	13784	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018533	CAAA	2	8	13786	13793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018533	TGA	2	6	13805	13810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018533	G	6	6	13820	13825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018533	CTTAAA	2	12	15246	15257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018533	AT	3	6	15291	15296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018533	ATTT	2	8	15333	15340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018533	TTTC	2	8	15351	15358	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018533	AAT	2	6	15371	15376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018533	GAG	2	6	15430	15435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018533	GTT	2	6	15441	15446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018533	T	6	6	15470	15475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018533	CTT	2	6	15557	15562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018533	GTC	2	6	15571	15576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018533	TAAA	2	8	15594	15601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018533	TCA	2	6	15604	15609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018533	AATG	2	8	15691	15698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018533	AAAT	2	8	15713	15720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018533	GTT	2	6	15727	15732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018533	TAA	2	6	15744	15749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018533	TGT	2	6	15757	15762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018533	ATT	2	6	15782	15787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018533	TGG	2	6	15801	15806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018533	TA	4	8	15817	15824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018533	GTA	2	6	15847	15852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018533	TTG	2	6	15855	15860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018533	TTG	2	6	15962	15967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018533	TAGT	2	8	15968	15975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018533	CA	3	6	15986	15991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018533	AAAGT	2	10	16000	16009	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018533	ATC	2	6	16031	16036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018533	AGGAAG	2	12	16058	16069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018533	A	6	6	16106	16111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018533	ACA	2	6	16170	16175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018533	TATT	2	8	16220	16227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018533	GAT	2	6	16301	16306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018533	ACC	2	6	16893	16898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018533	GAA	2	6	16969	16974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018533	GAA	2	6	16998	17003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018533	GAGC	2	8	17015	17022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018533	TGT	2	6	17032	17037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018533	T	7	7	17037	17043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018533	ATA	2	6	17128	17133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018533	GA	3	6	17189	17194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018533	GTTTA	2	10	17215	17224	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018533	GCT	2	6	17232	17237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018533	T	6	6	17322	17327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018533	GTT	2	6	17371	17376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018533	TGT	2	6	17408	17413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018533	A	6	6	17416	17421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018533	TTTA	2	8	17434	17441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018533	AATG	2	8	17477	17484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018533	TGG	2	6	17498	17503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018533	A	6	6	17504	17509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018533	ATT	2	6	17557	17562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018533	ATA	2	6	17691	17696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018533	GAAA	2	8	17787	17794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018533	CAA	2	6	17911	17916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018533	GTTT	2	8	17940	17947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018533	T	6	6	17975	17980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018533	A	6	6	18016	18021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018533	TGA	2	6	18028	18033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018533	TGT	2	6	18047	18052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018533	T	6	6	18052	18057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018533	TAA	2	6	18095	18100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018533	GGT	2	6	18164	18169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018533	TGA	2	6	18192	18197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018533	TTG	2	6	18202	18207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018533	TTA	2	6	18230	18235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018533	AAG	2	6	18243	18248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018533	AGCG	2	8	18787	18794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018533	TGT	2	6	18871	18876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018533	AAAAC	2	10	20070	20079	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018533	AAG	2	6	20205	20210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018533	AAT	2	6	20217	20222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018533	TG	3	6	20230	20235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018533	TAA	2	6	20244	20249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018533	AAT	2	6	20278	20283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018533	GA	3	6	20363	20368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018533	A	7	7	20442	20448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018533	GCAAA	2	10	20456	20465	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018533	AGT	2	6	20493	20498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018533	T	6	6	20550	20555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018533	ACA	2	6	20582	20587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018533	ACA	2	6	20642	20647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018533	CAT	2	6	20707	20712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018533	ATTT	2	8	20713	20720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018533	TGT	2	6	20724	20729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018533	TAC	2	6	20764	20769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018533	GCT	2	6	20810	20815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018533	T	6	6	20846	20851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018533	ATTT	2	8	20885	20892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018533	TTG	2	6	20966	20971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018533	AGG	2	6	21003	21008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018533	GGTGC	2	10	21061	21070	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_018533	TTG	2	6	21215	21220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_018533	TAAA	2	8	21369	21376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_018533	T	7	7	21507	21513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018533	TTG	2	6	21515	21520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_018533	AT	3	6	51931	51936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_018533	GA	4	8	52060	52067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
292	NC_018533	AAATC	2	10	52150	52159	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
293	NC_018533	GTA	2	6	52195	52200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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